A partir da versão 39.14/10.4.74.90 foi implementado um campo no cadastro de funcionários com o nome de Matrícula Banco, para acrescentar no caso os bancos que utilizam uma matrícula própria para identificação de seus correntistas ao enviar o arquivo de remessa bancária. 

Onde fica: 

Menu Funcionário > Cadastro > Funcionário > Dados Funcionais;

Observação: O campo Matrícula Banco só deverá ser utilizado para os bancos que utilizam uma matrícula diferente da já existente no cadastro de funcionários.